清华大学生物医学工程专业是属于清华大学医学院中招生的专业之一，医学院有三个系，那么该专业是属于清华大学生物医学工程系中一个专业了，该专业在2001年被评为国家重点学科，2006年再度被认定为国家重点学科。
1、生物医学信息检测与处理
2、生物医学仪器与系统
3、医学成像与医学图像处理
4、生理系统建模与仿真
5、生物芯片与医学系统生物学
6、生物医学检测与科学仪器
基础课：微积分、几何与代数、复变函数引论、随机数学方法、现代生物学导论；
专业课：工程图学基础、电路原理、电路原理实验、电磁场、微机原理与应用、 高级语言程序设计、数字电子技术基础、模拟电子技术基础、电子技术综合实验、信号与系统、自动控制原理、生物医学电子学等。
对于生物医学工程在职研究生排名中清华大学居于第六位。
清华大学生物医学工程系现有教师（不含深圳研究生院生物医学工程中心）33人。其中，全职教授/研究员19人；副教授/副研究员7人；讲师、实验技术人员7人。其中为清华大学在职研究生生物医学工程专业授课的老师有白净、高小榕、胡广书、周玉祥等人。
| 白净，女，清华大学生物医学工程系教授，主要研究方向：分子影像、生理系统建模与仿真、超声成像。担任校学术委员会委员、校外事委员会委员及专家组成员，电机系学位和学术委员会委员，国务院学位委员会第四届学科评议组成员，中国科协委员、中国生物医学工程学会学术委员会副主任及信息与控制专业委员会副主任、北京生物医学工程学会理事，IEEE高级会员、国家自然科学基金会评审专家。 |
清华大学在职研究生生物医学工程专业就业方向：毕业生中既有国际知名大学的教授，也有国内医疗仪器产业的领军人物，更多的是国内教学、科研、国防及产业方面的优秀人才。我系毕业生徐航所创立和领导的深圳迈瑞公司在美国纽约证券交易所成功上市，成为中国最大的民营医药企业。
清华大学生物医学工程专业培养目标：培养本学科领域能够从事理论研究的高水平的科学家和应用开发方面的杰出人才。
本学科先后完成国家“七五”“八五”科技攻关项目三项,国家重大自然学科基金1项,完成和正在进行的国家级自然科学基金30项,完成和正在进行的省部级自然科学基金12项,正在承担的国家“十五”863项目(包括子课题)共六项。近五年来承担的横向课题近20项。1995年以来,先后有8项科研项目通过了省部级的鉴定。先后发表论文800多篇,其中有50多篇发表在本领域国际公认的高水平期刊上,被SCI收录的有30多篇,被EI收录的有100多篇。
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