福建农林大学凭借良好的教学环境和教学团队开展在职研究生教学工作，福建农林大学在职研究生可以分为单证在职研究生和双证在职研究生，单证在职研究生是可以免试入学进修学习的，但是双证在职研究生需要参加1月联考入学才能顺利入学。福建农林大学双证在职研究生招生条件：（1）具有一专业以上学历，（2）有有3年以上或者是5年以上的工作经验。满足以上条件的学员可以报名参加福建农林大学在职研究生双证进修班。

因为在职研究生教学模式的特殊性，还有在职人员学习发展的需要，在职研究生是可以跨专业进修学习的，福建农林大学可招收农业推广硕士、兽医硕士、工程硕士三个专业学位研究生，其中农业推广硕士包括以下15领域：作物（095101）、园艺（095102）、农业资源利用（095103）、植物保护（095104）、养殖（095105）、草业（095106）、林业（095107）、渔业（095108）、农业机械化（095109）、农村与区域发展（095110）、农业科技组织与服务（095111）、农业信息化（095112）、食品加工与安全（095113）、设施农业（095114）、种业（095115）；工程硕士包括以下3个领域：生物工程（085238）、食品工程（085231）、林业工程（085228）。在职人员可以根据自己发展的需要选择相关专业进修专业知识。

福建农林大学在职人员攻读硕士学位研究生招收采取两段制考试方式。第一阶段，所有考生参加国家统一组织考试，该阶段主要测试考生的综合素质，福建农林大学实际情况自行确定报考本校农业推广硕士、工程硕士和兽医硕士研究生分数线。第二阶段，考生参加福建农林大学自行组织的专业综合考试和相关测试。