根据人才培养要求，各专业都建立了相应的符合实际的培养目标及培养方案体系。
光电系充分结合区域经济发展及产业升级过程中对高层次人才的需求，设置了光学工程、测试技术及仪器、光通信技术三个研究方向。对工程硕士专业学位研究生的培养注重培养实践研究和创新能力，增长实际工作经验，提高专业素养及就业能力;课程学习与实践课程紧密衔接，课程学习主要在校内完成，实习、实践在现场或实习基地完成。课程最低总学分为26，其中读书报告2学分，专业实践时一间原则上不少于1年。
为适应多元化工程硕士校企合作培养模式，结合开放式课程教学改革要求，光电系构建了“研究生网络课程平台”，该平台集成了光电系核心课程、模块课程、选修课程及专业实习等全部课程，10余门课程网站己在平台全面试运行。该平台为学生提供良好的自主学习平台和师生互动平台，为教师建设课程网站提供极大便利;实现了全系“教与学”信息的电子化和网络化;构建了学生的“学习信息库”，为全方位立体培养模式提供了必要的条件。
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