作为工科研究生教育领域的新生事物，与工学硕士相比较，工程硕士教育具有以下显著的特色:
在培养目标上，工程硕士是与工程领域任职资格相联系的专业性学位，侧重于工程应用和工程实践。工程硕士立足于为工矿企业和工程建设部门，特别是国有大中型企业培养和输送高层次工程技术和工程管理人才。
在招生生源上，工程硕士的招生对象是有实践经验、工作业绩突出的在职工程技术或工程管理人员，基本上是本单位的工程技术和工程管理骨干。工程硕士的招生人学考试，也经历了多次改革，2001年以前，工程硕士的人学考试均为各培养单位单独命题、单独考试，考试科目为数学、英语、专业基础和专业综合四门。2001年，根据国务院学位办的统一部署，工程硕士入学考试进一步改革，考试科目为数学(按专业领域分甲、乙)、外语、专业基础和专业综合共4门，其中英语、数学实行全国联考。在历次的人学考试中，全国均不划定统一的分数线，由各培养单位自行确定，择优录取，录取人数不得超过当年的录取限额。
工程硕士的教学模式，一般都采取“进校不离岗”的培养方式，因地制宜、因材施教，实行企业和学校双导师制，更注重学员在实践应用过程中对其理论基础的理解和掌握及对知识结构的更新和拓展。
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