高校与企业合作培养工程硕士过程中，企业的技术难题或攻关项目并非是完成一两篇工程硕士论文就可以解决的，需要经过高校与企业不断深入的合作，进行持续的研究才能获得想要的成果，因此，持续发展是以校企业合作培养工程硕士为平台和桥梁，形成产学研合作一体化的更广泛和深入的交流与合作，而非一次简单、偶然的短期合作行为。在此阶段，创新工程硕士培养管理模式，加大对人才培养的持续投入，校企长期合作和资源共享等是持续发展阶段的主要内容。
①校企共建工程硕士培养基地
校企共建工程硕士培养基地，实行双导师制，是建立合作培养长效机制的重要举措。培养基地既要起到企业与学校沟通的桥梁作用，与学校一起共同组织和安排教学及论文选题，还要作为工程硕士生的研究基地，为教学实施、工程实践与论文研究提供必要的条件。实践证明，校企共建工程硕士培养基地可以充分发挥各自在教育科研、成果转化、管理和资金筹措等方面的优势，加快提高自主创新的研发能力，促进自主知识产权和产品的成果转化。通过基地建设可进一步加强校企合作，一方面吸引高校的人才资源到基地参与项目合作，研发新技术、新产品，解决企业人才不足的困难;另一方面，也为高校科研提供了一个直接面向生产、面向市场进行研究开发的实践基地，共同培养高层次的工程技术和管理人才，实现学校和企业的跨越式发展。
②依托学校工程研究中心，促进工程硕士研究成果转化
高校工程研究中心主要从事工程性技术研发，促进和实现重大科技成果转化与应用，是国家重点研究开发基地;是国家为增强科技成果转化能力，发展工程科学技术而建立的基础性工程;是依托于有雄厚科研和技术实力的高校、强势企业的、在业务上相对独立的工程化研究实体。工程研究中心的一个重要任务就是培养高水平的工程技术与管理人才，促进研究成果转化，这与校企合作培养工程硕士的目标相一致。把工程硕士培养与工程中心的研究项目相结合，让工程硕士参与国家重点支持的科研项目，不仅为企业解决科技创新人才不足的问题，也通过这一平台使工程硕士在研究中科研能力得到锻炼和提高，从而促进学校与企业科学和技术的协同发展。
③引入市场化的工程硕士培养机制
工程硕士教育符合教育理论家约克。柯尔曼认为的培养有专门知识和技能的人才的教育市场化应具备三个特征:一是高校自治，政府给予高校充分的权利，使高校根据自身的特点和优势对市场信号做出迅速的反映;二是转变政府单一的资助方式，依靠政府和社会双方力量共同承担培养有专门知识和技能的人才的教育费用;三是培养有专门知识和技能的人才的教育市场的实质是“准市场’，[30]。工程硕士教育引入市场化的办学机制，适应了国家经济建设、社会进步、科技发展的需求，积极推进教育机制的创新与实践，推进教育培养由封闭式向社会开放式转变，教育管理由政府计划向高校自主办学转变。在市场化管理模式下，使用市场运作手段，使学校与企业的资源得到合理配置和高效利用，建立起计划调节与市场调节有机结合的机制，通过“政府宏观调控、企业积极参与、高校自主办学”的方式，为工程硕士教育的可持续发展奠定良好的基础。
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