工程硕士是从工学硕士中分离出来的专业学位。由于我国研究生教育是在1978年特定历史条件下恢复的，当时首先是满足教育科研战线人才短缺的问题。因此，工学硕士的培养主要围绕这个目标，侧重学术研究。经过多年实践，工学硕士的培养模式被沿袭下来，成为工学门类中单一的规格和类型。工程硕士专业学位的设立，改变了这种状况。工程硕士是带有工程师职业背景的专业学位，侧重务实和应用。工程硕士与工学硕士既有联系，又有区别。联系的纽带在“工”和“硕士学位”上，两者都是工学门类中硕士层次的学位，都具有一定的工学知识结构和工程实践能力，都是解决工程技术和工程管理中的理论和实践问题。但是由于两者的培养对象、培养方式、培养目标不同，设置的背景和指导思想不同，他们又有明显的区别。工学硕士的主要来源是应届本科生，适应社会各方面的整体需要和人才需要，为教学、科研、企业、社会培养通用型人才;工程硕士生的主要来源是企业推荐的具有学士学位、工作三年以上的优秀在职人员，本着为企业培养人才，提升企业人力资源素质的原则，以企业的需要为准绳，为企业培养特定型人才。工学硕士研究的是工程实际中遇到的理论间题，往往具有前瞻性和风险性，追求的是探索和创新;工程硕士研究的是工程中的实际问题，在专业理论指导下，凭借对实际问题的经验提出解决方案，具有可实现性、可见效性，追求的是效果和效益。工学硕士的培养主要立足于校内，培养学术型、研究型人才，为进一步充实教学科研领域和博士生生源储备人才;工程硕士的培养主要是不离岗的异地基地培养的复合型、实用型人才，为企业的技术改造、技术创新服务，提高企业的活力和竞争力。正是基于这些区别，工程硕士从传统的工学硕士中分离出来，成为一种独立的专业学位。
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工程硕士与工学硕士有着各自的特点，他们的优势表现在不同方面。根据各校两种规格硕士生培养方案，可以比较这两类硕士在主要知识、主要技能方面的相对重要性排序情况见下表。
两类硕士在知识和技能方面的相关系数接近于0，可见两类硕士有着明显的区别。工学硕士在知识方面强调基础理论与专业理论学习，在技能方面强调分析能力与批判性思维;工程硕士在知识方面侧重新技术、新手段、新工艺的获取，强调专业基础知识、经济管理、法律知识的传授，在技能方面侧重应用能力、决策能力和交流、协作能力的培养和训练。在素质培养方面，工学硕士强调综合和分析能力、理论论证和创新能力，他们的主要任务是学习，在课堂、实验室或者工程实际部门学习、试验和考察，理论知识掌握得比较系统、扎实，科研能力较强，通常善于程序化决策;工程硕士强调组织、协作、系统整合、实际论证与技术创新的实战能力，他们由于长期在企业从事实际工作，每日面对实际工作现场，实践经验比较丰富，解决实际问题的能力较强，而且要在各种复杂的工作环境和人际关系的压力下，作出应急决策，通常善于非程序化决策。由此我们可以看出工程硕士在知识、能力、素质要求、思维特点等方面有着不同于工学硕士的特点，是一种与工程领域任职资格相联系的规格，重在工程素质、工程技能、职业道德和敬业精神的培养。把握工程硕士的这些特点，也就把握了工程硕士专业学位的特色。我们要提高工程硕士专业学位质量，就应树立正确的工程硕士质量观，就应针对工程硕士的特点，以突出特点、显示特色为参照指标来制定工程硕士生的质量标准和培养方案。这样才能使工程硕士真正成为适应社会需要的一种新规格的高层次技术人才和管理人才。离开工程硕士特点的质量要求，既不符合专业学位设置目的，也不适应社会需求，工程硕士专业学位就不可能独立生存和发展。
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