交通运输工程学科的理论和专业基础包括电气、电子、土木、机械、材料、信息工程、管理等科技领域，涉及交通基础设施的布局及修建、交通信息工程控制、载运工具运用、运输规划与管理以及交通运输的现代化及安全技术等。合肥工业大学凭借良好的教学环境组织开展在职研究生教学工作。

合肥工业大学在职研究生通过专业学习，可掌握交通运输工程领域坚实的基础理论和宽广的专业知识，掌握解决工程问题的先进技术方法和现代技术手段，具有独立担负工程技术或工程管理工作的能力。

合肥工业大学在职研究生交通运输工程专业以课程教学为主，在课程教学安排上主要体现以下几点：

课程采用学分制的管理方式，主要课程为必修课程和选修课程，课程设置如下：

必修课：英语、自然辩证法、数理统计、矩阵理论、系统建模与计算机仿真、交通运输工程学、交通运输与规划理论、现代控制工程、状态监测与故障诊断。

选修课：运输工具系统动力学与控制、高等运筹学、测试技术与信号处理、交通流理论、人工智能与专家系统、可靠性理论及分析、数字图象处理、交通运输系统分析、环境工程与环境保护、交通控制决策、物流系统优化与仿真、现代道路设计的原理与方法、桥梁结构分析、高等路基路面设计理论、城市规划原理、现代物流基础理论、车辆工程专题、数据库原理及应用、交通安全系统工程、交通管理与控制、微机原理、交通工程设施设计、交通安全学、模糊数学、交通仿真技术、维修工程基础理论与方法、表面工程、智能运输系统、交通工程总论、交通控制与管理、汽车运用工程。