首先华中科技大学EMBA项目课程设计上大部分采取分块的模式，每个模块各自解决一个问题，缺乏系统性与综合性，在职EMBA学员们不是学过一门课程后就自然能将所学的知识融会贯通，纳入到原有或预定的综合知识体系中去。出现只注重单一课程功能而忽视各门课程统合和知识综合应用的问题。

其次可以看出华中科技大学EMBA项目的课程内容，大多直接使用国外原版教材或翻译教材，很多案例直接来自于国外，缺乏自己的教材。由于缺乏根据中国实际编写的案例，教学的效果受到较大的影响。应该鼓励更多的教师深入企业撰写案例，成立案例中心专门负责中国案例的开发，并建立名校案例交流制度。

再次华中科技大学EMBA课程设计上目前还只是停留在单纯的课堂教学上，所以，华中科技大学EMBA可建立第二课堂、课外活动为广大的学员提供了互相沟通、互相学习的平台，可结合校园文化，设计系统的有规划性的非科目的课程或隐性课程，为华中科技大学EMBA项目课程设计注入新的创新方法。

另外，华中科技大学EMBA也可以借国外高校的做法:打破课程设置中各学科、各课程间块块分割、自搞一套、各自为战的离散状态，从综合的观点出发，把各种不同目标的课程结合成为一个具有整体功能的教学系统，以培养21世纪复合型的商业领导人而不仅仅是具体的财政管理人员。