MPA的课程按一级学科设置，课程结构分为核心课程、方向性必修课和选修课。核心课程为各个试点院校必修课，其中一门核心课程由各个试点院校根据自身特色自行安排。方向性必修课由各个试点院校根据培养对象不同按统一要求选择一组。选修课由各个试点院校根据自身特色和培养对象要求自行组织，力图多样性。

显然，MPA在应用领域方面更为开阔，课程体系设置既考虑学员原来的专业背景和应用领域的差别，还考虑学校的多学科的综合优势，不因应用性强，而忽视MPA教育与行政管理专业在教育内容上有厚此薄彼的倾向。目前MPA专业课程体系的设计应当考虑以下原则：

1、科学性原则

公共管理学是现代社会科学的重要学科之一，有其理论发展的独立性和学科建设的规范性。尽管世界各国由于社会制度和国情背景的不同，有很大的差异性，在研究课题和观点立场上甚至带有相当浓厚的政治倾向性和功利性，但是，并不妨碍这一学科循着理论研究规律的发展。同时，也应当注意，在我国，受执政党的指导思想和中心工作的影响，公共管理学的研究带有鲜明的时代特色和现实要求，公共管理学的教科书往往吸收符合某一特定时期政治要求的有关内容，这或多或少影响了学科研究方向和内容上的稳定性和独立性。强调科学性原则，并不是否定行政学的政治标准和政治倾向，而是，从短期特定和狭隘的政治目标和政治标准中适当超越出来，以公共管理学的基本对象和任务为研究重点，保证学科发展的规范、严谨和相对独立性，这样能够高屋建瓴、客观公正地研究行政行为和行政现象，恰恰是维护了公共管理学研究导向的党性与科学性的统一。

2、系统性原则

公共管理学作为一门独立的社会科学，属于社会科学体系的重要组成部分。同时，又是由有着内在逻辑关系的诸多课程组成的统一整体。系统性原则就是要在确定公共管理学独立的研究对象的同时，对涉及行政管理领域的诸多问题逐一分解，从基础理论、实际应用领域、方法技能等三个层面，政府行为、公共组织行为以及政府、非政府公共组织与企业、市场、社会等多边关系的层次方面交织建构学科课程体系的框架。课程体系建设的系统性原则，不是将有关课程简单地罗列和堆砌在一起，而是应当处理好课程的理论与实践、先行与后续、专精与广博等关系，保证中心突出，重点明确，结构合理，详略得当。

3、应用性原则

公共管理学是社会实践性很强的学科。现代社会中，公共组织发展、行政体制改革、公民参与与社会自治为公共管理学的发展提供了大量可供研究的素材资料，也提出了很多全新的观念和课题。应用性原则就是要始终把关注社会政治经济文化的变动放在教学研究的重点位置，通过社会实践推动学科的理论检验、理论诠释和理论创新，在实践中不断总结行政学研究的新方法、新思路和新观点，进而上升到理论的高度。应用性原则既要防止重视理论教育、轻视方法技能训练的倾向，也要防止一味追求应用技巧和实际经验，而脱离基本理论教育和基本能力培养的急功近利的教学倾向。

4、开放性原则

课程建设的开放性原则是要跳出拘泥于传统的课程设计思维定势，改变片面强调学科的专业性而自我封闭的倾向。要注意现代社会公共领域逐渐扩大、行政管理职能转变的趋势，汲取有关学科对公共管理领域研究的成果，特别是要与法学、政治学、经济学、管理学等学科密切合作，开发有关交叉学科、边缘学科的领域，逐渐形成一批特色课程。这种开放，带有双向、全方位开放的特点，既要向外吸收新鲜知识营养，也要向外输出本学科的最新研究成果。正如系统论创始人维纳所说：“科学发现的无人区，往往在学科的交叉边缘地带。”可以想见，开放的结果，必将拓宽行政学研究的领域，完善行政学研究方法，促进行政学的学科发展。

5、前瞻性原则

从遵循教学规律角度来说，课程名称、内容和教学结构应当相对稳定，这也符合学科建设的方向和目标应当相对稳定的要求。但是，由于公共管理学是一门较新的学科，也是发展比较迅速的学科，特别是在开放性、全球化、信息化的现代社会背景下，学科建设应当反映基本的实践动向和最新的研究成果。比如，计划体制国家在向市场体制转轨过程中出现的行政管理职能转变的趋势，知识经济时代电子政务、电子政府发展的趋势，政治民主化浪潮中出现的非政府组织公共管理职能扩大化、公民社会自治热情高涨的趋势，以及经济全球化背景下的政府国际活动加强的趋势，都是非常值得研究的。当然，前瞻性原则是要注意稳定与变化相结合，既要保持行政学课程体系框架和主干课程的基本稳定性，又要注意调整、充实相关课程及其内容，反映学科发展的基本趋势，将实践检验和学界公认的理论范畴、应用方法等尽快吸收进来，发挥理论指导实践的积极功能。