导师指导对于促进在职硕士的自主发展具有重大意义，现今我国在职硕士招生人数的巨幅增加带来了导师资源的紧张，影响了在职硕士的培养质量。为此，学校首先要提供广阔的资源空间，严格选拔一批具有相应资格的教师，同时提高已有导师的指导能力，以优秀导师为核心促进导师自身的教育观念和职业素养的提升，以此来带动导师队伍的整体素质的提高，从而在一定程度上缓解在职硕士师生比例不和谐的困境。
其次，为了改善导师“学徒式”的指导方式带来的在职硕士单一学科领域的发展局限，一方面导师要加强自身的学识，掌握具有跨学科的知识结构，保证该结构一直处于动态的更新状态，而且还要专长于一两门学科，做到基础深厚，系统深入，能够将相关的学科知识融会贯通，互为所用;另一方面，指导在职硕士的导师队伍可以采取灵活的指导方式，如施行导师制与课题小组制相结合的指导，也即是说由同一学科，同一专业的导师或者由共同合作参与课题的相近学科专业的导师组成导师小组，在职硕士根据自己的兴趣目标和发展方向来确定参与课题，导师通过课题来了解在职硕士的学术水平、发展取向等，最终形成合适的导师指导组合，进而给予在职硕士更加贴切更加深入系统的指导与培养。
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