在职硕士教育在我国实施的是“师徒制”，即一个导师带一至若干个学生，这种师徒式的教学方式最大的优点在于其灵活性，师生之问有足够的条件相互交流，所以教与学是易于沟通的。但是，“师徒制”容易导致“因材施教”的现象。因为无论是多么有才学的导师，其个人的学术兴趣、学术能力注定是有限的，一师一徒式的教育方式必然导致培养类型的狭窄化、培养目标的狭窄化。所以，在在职硕士创业教育中实施“双导师制”。
“双导师制”是指导师除校内名师指导外，还聘请社会各行业著名企业家、专家学者、成功人士共同指导在职硕士。即每一位在职硕士都有一名校内导师和一名社会导师共同指导。
校内导师主要负责学生的理论学习，培养学生在专业方面的理解能力、认识能力和创造能力。如果学生能参与导师的科研、教研研究或实践工作，不但学生会得到很好的锻炼，教师也将从中受益。
校外导师主要培养在职硕士理论联系实际的能力，增加实践认知能力。由于在职硕士特别是博士生毕业的标准主要以高质量的论文来衡量，而且有些专业在职硕士的论文选题主要来白企业的研究课题或工程项目，所以校外导师可以创建实习基地，提供实战机会，促进学生管理能力的提高。
2005年12月31日的《人才报》刊登了这样一则消息:目前，上海市政府9部门已联合发文拟建立“在职硕士联合培养基地”，首批7个基地即将在大型科研院所和企业集团挂牌。此举标志着企业里的专家将成为高校在职硕士导师，高校课题研究与社会需求脱节的状况有望得到改观。据介绍，在新建立的培养基地里，高校可在企业、科研院所的高级研究人员和技术人员中遴选导师，企事业导师享受高校导师同等的学术待遇。在整个在职硕士培养的过程中，课程设置和学位授予过程在高校进行，学位论文工作可由企事业导师指导并在培养基地完成。
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