北京航空航天大学EMBA的教学分为必修和选修两方面.其中必修课主要分为三大块，第一、基础科学类;第二、宏观经济类;第三、工商管理类。选修课程则会根据学员具体状况进行调整，总体上符合北航经管学院的院训:“尚学敏行、经世至善”的内涵。

北京航空航天大学EMBA的核心课程包括:战略管理、领导学、管理经济学、财务管理、人力资源管理、组织行为学、营销管理、运营管理、企业社会责任与商业伦理、社会主义经济理论与实践、商务英语与沟通、数据模型与决策等。选修课程包括:资本运作与企业重组、公司治理、宏观经济与政策、财务报表分析、中国文化与管理、技术创新管理、经济法等。

北京航空航天大学EMBA中心主任张教授介绍到:“北京航空航天大学的管理科学与工程专业是全国前三的实力，这一平台的起点是十分高的。”专业的课程设置以及不凡的教学实力是能够让学院脱颖而出并且持续发展的必要条件。而对于在职EMBA学员来说，这些因素则是自身能够在这个平台中不断进步的。