目前，关于重庆大学EMBA教育的毕业论文，充分体现专业学位研究生培养模式的特点，不同于科学学位研究生的培养模式，着重强调其专题性、针对性和问题式导向、方案设计式导向的指导和培养质量。首先，必须在专业培养目标和培养规格的框架下，遵循理论联系实际的客观规律去研究、思考问题，也必须在学生已经学过的理论和可操作的方法指导下研究问题。

其次，加入在职EMBA毕业论文选题来自企业实践性、咨询策划类等横向研究课题为主体的选题和研究，对其评价机制尤其强调论文选题中涉及目标企业的应有目标企业的领导或管理一者参与，以确保毕业论文从选题到企业实践甚至部分学生的工作实践等环节研究、思考的问题更切合论文题目本身研究的内容；最后，重庆大学EMBA论文形式多以案例分析与研究、市场调查与研究报告、商业计划和商业文案等方面为主。

此外，积极探索更适合重庆大学EMBA背景下EMBA学员的论文课题方法。通过课程评价方式的改革，积极地培育重庆大学EMBA学员将所学管理理论与管理实践相结合的思维方式。