众所周知，课程设置是关系着在职EMBA培养院校教学质量的因素之一，那么就东北财经大学EMBA现行的课程设置还存在着一定的差异和不足，其主要表在以下两个方面：

课程结构不太合理

EMBA课程结构指EMBA课程各部分的组织和配合，即探讨课程各组成部分如何有机地联系在一起，使它们相互配合、协调一致、共同来完成EMBA教育目标的问题。EMBA课程在各个学校的称呼有所不同，如国内有基础课程、核心课程、学位课程、必修课程、公共选修课程、专业选修课程、选修课程等，国外有核心课程、基础课程、选修课程。一般而言，EMBA课程可大致分为必修课程和选修课程两类。

课程设置内容不够全面

在面临的新的竞争需要和日益全球化的大环境下，东北财经大学EMBA教育正向差异化发展并且重新定义自己，在面向迅速变化的企业环境同时，越来越重视面向市场，即企业和EMBA学生的需求。这主要反映在国内外各商学院EMBA的课程内容向着跨领域、跨学科课程发展，课程内容除了企业管理基础知识—财务金融、战略、作业管理、市场营销等等外，而且还概括了怎样与人共事，怎样激发别人和如何在解决问题时做到总体把握。在今天的东北财经大学EMBA教育内容中，较强的沟通能力和人际交流技巧与知识同等重要。此外，各个商学院还非常强调课程内容具有前瞻性，如企业家精神、道德、信息技术管理和领导艺术等方面都作为了课程设置的内容。