在菜单式制定培养方案的基础上进行菜单选课，使学员根据自己的喜好和需求制定培养计划，突出因材施教原则。可采用灵活的教学方式，充分利用网络资源，开发网上课堂。
针对工程硕士入学时基础知识较为薄弱的事实，在安排任课教师时，除需具备研究生任课教师遴选的条件外，应特别注意对教师责任心、授课方法的考察，并针对工程硕士的实际情况进行教学改革。所选聘的教师应都具有指导研究生的经历，从事课题的研究工作，这样使课程理论与实际相结合，使学员既能在理论上有所提高，又能把所学知识用于生产实践。此外，为加强工程实践性，可聘请企业有着丰富工程经验的工程人员来学校给工程硕士研究生做专题讲座。
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