内蒙古大学EMBA实行的是学分制，所以内蒙古大学EMBA学员在报考前就最好弄清楚内蒙古大学EMBA的课程设置，以免日后影响自己在内蒙古大学EMBA的学位证书的获得。

内蒙古大学EMBA的课程将实践和理论平衡起来，注重强调整合性和决策导向性；同时于国际经济形势挂钩，强调密切联系实际和面向国际竞争环境。并且国内的EMBA课程大部分会借鉴国外和境外大学课程设置。然后结合我国的实际情况，将内蒙古大学EMBA课程分为必修课、核心课和选修课三类：其中内蒙古大学EMBA必修课包括：社会主义经济理论与实践、商务英语。将英语作为必须课，就对学员的英语修炼提出了高标准的要求。

然后，内蒙古大学EMBA主要的核心课程有：有围绕着经济管理的管理经济学、组织行为学、国际企业管理、人力资源管理等，有围绕着整合性的的数据模型与决策、会计学、公司理财、营销管理等，也有围绕这管理决策导向性的战略管理、信息管理、和领导学等等。具体模块选择内蒙古大学EMBA学员要依据自己的兴趣爱好去做出选择。

内蒙古大学EMBA其他相关联的选修课主要有：主打技术项目的运营管理、人力资源管理与开发、技术创新管理、项目管理等；主打企业管理的有创新与变革管理、知识管理、企业研究方法、管理沟通与谈判、商业伦理等；主打综合性理财投资的领导学、危机管理、财务报表分析与经营决策、项目投资与融资决策、风险管理等；紧随时代步伐的电子商务、商法、国际金融、企业政策、公司治理等等；其他一些的环境管理、现代科技知识、公共政策等。