在北京交通大学里面EMBA与MBA及其他学位教育的招生方式不同；在北京交通大学EMBA招生过程中，通过以资格审查、面试和笔试三种方式相结合，由北京交通大学EMBA自主命题来考试并决定录取，而普通课程入学的硬性标准为笔试成绩，而北京交通大学EMBA的笔试仅作为参考，最重要的还是资格审查。

北京交通大学EMBA考试是由院校自己制定考试录取办法，自行组织考试，录取标准以考生的职业成就、能力测验和面试成绩为主，是对传统招生模式（通过全国统一考试招生）的一次大突破，在职EMBA教育摆脱了传统教育的以笔试为主的考试模式，看重考察考生的管理能力和发展潜力，非常有利于选拔具有更多管理经验的人才入读。

北京交通大学EMBA特别适合于那些实际管理经验丰富但离开应试环境多年的企业和政府高层人士；必须有8年以上的工作经验，并且必须有4年以上的管理工作经验。而且，必须是当前任职较大规模企业的高层管理人员才能报名；最初国家对EMBA学生的学历层次招生设置要求最低必须具有国民教育系列的本科学历；而事实上，EMBA的院校中能真正按要求完成招生指标的尚不足一半，生源的缺乏致使一些院校暗自降低了招生门槛。

对此，国务院学位委员会专门就EMBA招生下发通知，EMBA报名者允许有10%的大专学生，这样，一部分的确有培养潜质，但因为学历达不到本科这一要求的企业家将不会被拒之门外。学员在选择EMBA项目的时候看重的还是大学的牌子，几乎所有的学校在招生时都是在用己有的品牌，这样一来，使得高校问的差距很大，出现了两极分化的现象。