双证在职研究生和全日制研究生在教学管理上具有一致性，都是采用学分制管理方式，在课程的设置上根据学科特点和社会发展的需要组织开展专业课程的教学工作，双证在职研究生专业课程可以分为学位课程、非学位课程，学位课程包括必修课程、专业课程、非学位课程主要是选修课程、实践课程，部分的专业不要求在职研究生参加专业校外实践部分，因为双证在职研究生本身就具有一定的实践能力，但是部分专业科研实践该是要参加的。
硕士生的学习实行学分制，学制一般为2到3年，多数都是3年，也有2年半的。一般来讲，前两年是基础课和专业课学习时间，通常可以修完绝大部分学分；第三年用来完成毕业论文、实习和求职。许多学校都规定，如果提前修完所要求的学分，并符合一定条件的，可以申请提前毕业。按照规定，在职硕士生的学习年限可相应延长一年，但是需要向学校提出延长学习年限的申请。采用学分制的好处就是更加系统的进行教学管理和教学工作。
双证在职研究生专业课程所修学分和全日制研究生是一样的，在职人员在校期间需要参加专业课程的学习和专业课程考核修学分，还要有自己的学术论文，参加学术论坛，按照学校的要求完成相应的专业课程的学习。
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