2009年6月，新疆财经大学获教育部及国务院学位委员会批准，成为全国62所EMBA招生院校之一，也是新疆唯一一所EMBA硕士学位教育机构。

根据该校“建设新疆名牌、西北一流、全国知名、辐射中亚的高水平财经大学”的办学目标，新疆财经大学EMBA教育秉持一贯的“为新疆经济社会发展服务，为中国企业走向中亚服务”的办学理念，立足新疆，辐射中亚，旨在培养具有国际视野和领导技能、富于创新精神的高级管理人才，引领新疆财经大学EMBA教育向“求真务实而高瞻远瞩”的方向稳步迈进。目前，前五期共招收新疆财经大学EMBA学员570人，累计共计124人取得EMBA硕士学位。

新疆财经大学EMBA项目借鉴国内外著名商学院的课程设计方案，采纳与国际和时代同步的培养体系，培养环节包括课堂教学、海外游学、移动课堂、专题讲座等，着力培养新疆财经大学EMBA学员的战略思维能力与领袖素质。

为保证新疆财经大学EMBA教育工作的顺利开展，学校成立了新疆财经大学EMBA教育领导小组，充分发掘国内外优秀教师资源，选聘既有深厚理论功底，又有丰富实践经验的高水平教师为新疆财经大学EMBA学生授课;同时聘请国内外的一些知名的学者、专家和政府官员、成功的企业家担任客座教师及讲座嘉宾。新疆财经大学EMBA教学中提倡互动式的案例教学，鼓励任课教师组织学生，结合企业面临的实际问题开展研讨式教学。课堂教学之余，学校不定期组织国内移动课堂、区内移动课堂、海外游学等教学项目，前四期新疆财经大学EMBA同学分别赴国内海南、内蒙、河南、山西及区内喀什、巴州、伊犁等地移动课堂，并三次赴欧洲进行海外游学，学员反映良好。

新疆财经大学确定MBA学院为新疆财经大学EMBA培养单位。