1、政策不成熟

自主招生在职研究生考试考试政策是在国家的统一部署下再根据学校的具体情况进行操作，但是任何一项政策的制定都必然会出现漏洞，需要不断地通过实践的检验发现问题再不断进行修改。在实施自主招生在职研究生考试的过程中，国家针对的是特殊人才，但是真正实践操作起来，由于经济和本身教育的局限，很多偏远地区或者农村地区的考生不能真正享受到国家的政策，而且所谓的特殊人才国家也没有对其进行一个鉴定，没有可供操作化的指标，因而各个学校都只是按照自己的意愿，招收符合自己学校利益的学生，而往往那些所谓的偏刁一、怪刁-被大学拒之门外。

2、新的教育不公平

一直以来中国的教育伴随着经济发展的速度差异，出现了严重的两级分化的局而，在城市里可以接受更好的基础教育，而且绝大多数的名校也建立在大城市。据统计中国大学的50强，北京一个城市就占到了二成。在知识改变命运的今天，高校教育机会均等是教育公平的一个重要方而，然而，教育机会的获得过程是一个利益配置和}能力角逐的过程。在这个过程中，高校自主招生在职研究生考试考试成为教育机会配置的一种重要手段。但这个手段在很大程度上忽视了农村地区和贫困家庭子女受教育的权利，造成了新的教育不公。

据湖南师大的数据统计，2010年获得自主招生在职研究生考试资格的学生，农村学生不足10%，参加2010年清华五校联考和北大二校联考的，绝大多数是城市学生。针对农村地区考生难以搭上自主招生在职研究生考试考试列车的状况，2011年，清华大学推出了自主招生在职研究生考试“B计划”，特别要求中请人必须长期在欠发达地区学习、生活。但是尽管如此，五花八门的考试内容也是农村考生通过的“绊脚石”2010年高校自主招生在职研究生考试中，“偷菜”、“网瘾”等年度热门话题进入了试题，这对于很少有机会接触网络的农村考生是很有挑战性的。

3、诚信机制不健全

(1)学校方而。在实行校长推荐制后，很多中学实行的都是推良不推优的做法，因为在整个升学率的压力下，中学要保证它更多的学生能够上名校，本来就成绩优秀的学生即使不通过推荐也依然能够凭借自己的实力考上名牌大学，而本身成绩良好的学生凭借校长推荐或许也能够跨入名校的大门。@有的中学甚至会通过弄虚作假的手段，通过一些假的竞赛获奖证明或者假证书，将学生推荐给高校，这种行为严重破坏了自主招生在职研究生考试原来的目的。

(2)考生方而。这几年，自主招生在职研究生考试考试越来越受到家长们的关注，越来越多的考生加入到自主招生在职研究生考试考试这个阵营，但实际上很多"f,生并不只是希望借助于自主招生在职研究生考试考试来考上一所大学，而是希望通过这场考试给考上高校加一分保险。能够凭借自己的实力考上名牌大学，而本身成绩良好的学生凭借校长推荐或许也能够跨入名校的大门。@有的中学甚至会通过弄虚作假的手段，通过一些假的竞赛获奖证明或者假证书，将学生推荐给高校，这种行为严重破坏了自主招生在职研究生考试原来的目的。

(2)考生方而。这几年，自主招生在职研究生考试考试越来越受到家长们的关注，越来越多的考生加入到自主招生在职研究生考试考试这个阵营，但实际上很多"f,生并不只是希望借助于自主招生在职研究生考试考试来考上一所大学，而是希望通过这场考试给考上高校加一分保险。

4、社会认可度不高

自主招生在职研究生考试制度从开始实施起就遭受着来自社会各方而的非议。中国农业大学校长柯炳就曾发表文章《关于高考招生制度改革的几点认识》，矛头直指目前自主招生在职研究生考试考试存在的诸多弊端，认为当前自主招生在职研究生考试的实际效果与期望之间有不少偏差，自主招生在职研究生考试考试与99.9%以上的考生没直接关系，较大规模自主招生在职研究生考试联盟的出现使得自主招生在职研究生考试笔试更像另一次高考。