医学研究生的培养是培养有专门知识和技能的人才的教育的重要组成部分，它担负着培养高层次医学专业人才和发展医学科学双重任务，在高等医学教育和科学研究中发挥着重要作用。医学研究生作为高级医学人才，既要有扎实的临床能力，又要有扎实的科研能力。与科学院系统或综合性大学的研究生相比，临床医学在职研究生多为从事临床工作3年以上的医师，具有丰富的临床工作经验而科研意识相对比较淡薄，在科研方面普遍存在起点低、科研基础较差的问题。但在现代医学科学技术快速发展的今天，临床医学研究生不仅需要掌握系统深入的专业知识，还必须具有良好的科学素养和科研能力，才能适应现代社会医学发展的要求。目前多数临床在职研究生仅能在晚上或双休日有限的时间里完成理论学习，时间短、任务重，在通过理论考试后更不知如何进行科研工作。因此如何培养临床在职研究生的科研实践能力和科研探索能力，是需要重点思考和解决的问题。
1、创新能力的培养
创新是对自然现象规律的新认识、科学理论学说上的创见，是科学原理、机理的进一步阐明以及研究方法、手段上的创新。创新能力的培养是研究生教育的核心内容。在职硕士阶段也是个人创新能力培养、形成的重要阶段，对研究生今后的科研生涯至关重要，所以必须重视培养创新意识和提高创新能力。导师应该在授课的过程中结合实际工作指导学生进行科研选题和立题，注重培养研究生在理论学习、科学实验研究和临床技能操作中的创新能力，模拟实际科研中确立目标时可能出现的问题，引导研究生自己发现问题，鼓励研究生形成积极求异、积极变通和发散的创新思维。为研究生创造机会参与各种形式的学术交流活动和科研工作，营造良好的学术氛围。通过向研究生介绍本专业发展的最新前沿动态、最新实验技术手段与方法，激发研究生的探索欲望。
2、科研设计能力的培养
科研设计的好坏直接决定了科研课题的科学性、先进性和可靠性。因此科研设计能力是研究生科研能力的一个重要体现。研究生学习阶段必需掌握科研设计的基本原则，如合理的对照、盲法随机化、重复和均衡分配的原则，只有这样得出的研究结果才具有可重复性和可信性。科研设计能力的培养一方面可以通过有经验的科研管理人员为研究生讲解如何撰写科研课题标书进行指导；另一方面可以通过对科研课题相关文献进行检索、阅读和综述的过程中得到提高。在职研究生在确定自己的课题之前，应深入阅读文献，充分了解自己课题及相关领域的最新进展，综述研究所涉及的研究背景、设计方法、结果及尚存在的问题。对自己课题研究设计不断提出问题并进行修正解决，并将其以读书报告的形式进行汇报和讨论，倾听修改意见，养成及时阅读文献和总结归纳的良好习惯，在学习思考的过程中使自己的科研设计能力不断提高。
3、基础实验能力的培养
临床在职研究生在本科阶段偏重理论课学习及临床实习任务，而忽视了基础实验能力的培养，尤其是分子生物学实验基础薄弱。进入临床工作后由于工作紧张，参与实际科研的时间有限，又缺乏学习基础实验原理及技能的机会。然而，研究生阶段的课题研究，不仅要求研究生具备扎实的基础医学理论，还需具备基本的生物学实验基础。但大多医学在职研究生都对基础的分子生物学理论知识了解有限，对实验技术不熟悉。这些都极大影响了研究生的科研实验能力，也给研究生的实际科研工作带来阻碍。因此，应该鼓励研究生尽早进入实验室，积极学习甚至参与实验，掌握实验方法，学会详细观察实验的现象、综合分析实验的结果，切实提高实验的操作能力。
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