北京航空航天大学生物医学工程专业是属于北京航空航天大学生物与医学工程学院中招生的专业之一，该学院中的生物医学工程专业在2012年在教育部门评估中排列第六，并且该专业成为了学院中重点建设学科。
1、生物力学
2、生物医学材料
3、细胞与组织工程
4、生物医学信息及仪器
5、人体行为与康复工程
6、生物技术
7、空间生命科学及生命保障技术
8、航空航天生物医学工程及人因工程
公共必修课：马克思主义理论、第一外语、人类学专题课；
学位必修课：矩阵理论、数值分析、数理统计、微分方程与动力系统、数学物理方程、生物医学基础数学、生物医学工程研究方法、高级生物化学、高级解剖生理学、生物力学工程、人体工效学及康复工程、生物系统建模和仿真、数字信号处理、数字图像处理与识别、生物医学仪器分析、分子细胞生物学和组织工程、空间生命科学、医学图像处理及成像技术、生物医学工程软件技术等。
对于生物医学工程在职研究生排名中北京航空航天大学是属于B+类院校，属于B+类院校共有17个，在这些院校中北京航空航天大学居于第十位。
北京航空航天大学生物与医学工程学院共有专任教师55人， 95%以上具有博士学位，85%以上具有海外留学经历。其中为生物医学工程专业授课的老师有樊瑜波、庄逢源、李德玉、邓小燕、孙联文等人。
| 樊瑜波，男，北京航空航天大学生物与医学工程学院院长，教授、博士生导师。主要从事生物医学工程、生物力学、组织工程、航天航空生物医学工程、康复工程研究。现任世界生物力学理事会理事，全国生物力学专业委员会主任，中国生物医学工程学会理事长，中国力学学会理事，教育部“生物力学与组织工程”重点实验室学术委员会副主任等。 |
北京航空航天大学生物与医学工程学院是北航国际交流最活跃的单位之一，与美国、欧洲、俄罗斯、日本、香港等国家和地区的国际一流大学、研究机构都有广泛的实质性合作，已经与密西根大学、哥伦比亚大学、香港中文大学等签署了本科生交换协议；目前有10%左右的学生在本科阶段被公派到境外进行学习和实习，未来5年内，这个比例将增加到25%。
北京航空航天大学在职研究生生物医学工程专业培养目标：掌握生物医学工程及其相关的生命科学、工程科学、计算机技术、信息技术和生物技术等学科专业的基础理论与技术，具有从事本学科及相关领域的科研与开发和教学工作的能力。比较熟练地掌握一门外语，能熟练阅读本专业的外文资料。具有良好的综合素质。具有从事科学研究或独立担负专门技术工作的能力，有较强的适应能力。
北京航空航天大学生物医学工程专业老师已与国际国内知名大学和研究机构进行了广泛的交流和合作，获得并完成过国家科技攻关、军事预研重点、国家973、863计划、国家自然科学基金重大计划及多项横向应用研究课题，获得过国家级奖励。在国际国内公开发表了近诸多SCI、EI和ISTP等收录和其它级别的学术论文及多项专利。
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