工程硕士专业学位论文质量管控措施与管控模型相对应，包括选题、文献检索、开题、论文写作、答辩和修改6个子过程，这里将研究与写作和检查过程合并，简称论文写作，如图4所示。
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在选题阶段，主要关注师生的见面次数，工程硕士专业学位花多长时问通过选题;在文献检索阶段，学校开放检索系统，以方便工程硕士专业学位查阅文献资料，要求工程硕士专业学位至少查阅20篇以上的文献，在论文写作完成时，至少有30篇参考文献，同时，英文文献不少于10篇;开题结束标志是工程硕士专业学位通过开题报告，导师在开题报告中签字确认;论文写作过程主要通过检查报告来体现，通过检查报告了解师生见面的次数和讨论的内容，研究中遇到的问题和解决方案;答辩前，须审查开题报告、检查报告和论文初稿是否己经完成，并经导师签字确认，另外学校1年会提供2次答辩机会，以方便工程硕士专业学位择机答辩，答辩中的一个关键是如何判定论文是否达标;一般来说通过答辩的论文还需要作适当修改，以满足学校规定的论文要求。
在论文写作过程中存在的问题及改进措施归纳如表1所示。
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关于工程硕士专业学位论文的评价标准问题，虽然每位指导教师心里都有一杆秤，但要清晰地表达出来，并非易事。作者结合相关文献论述，总结归纳出一篇在职工程硕士专业学位论文是否达到要求，至少可以从以下4个方面来评价:
1、问题的提出及研究意义和研究价值
工程硕士专业学位论文选题有明确的工程背景，来自于工程实践，不是空穴来风或纯理论研究。作为工程硕士专业学位论文需要有一定的学术价值，是现实问题的提炼和升华，要么形成新的理论，要么是对现有理论的辛卜允和完善。
2、研究方法的科学性、合理性和可行性
工程硕士专业学位论文研究工作要有一定的技术难度、深度和先进性;表明论文作者具有综合运用科学技术理论和方法解决工程实际问题及技术攻关的能力。工程硕士专业学位论文要具有解决工程实际问题的新思想、新方法和新进展或是有新工艺、新技术、新设计的先进性和适用性。此外，还要保证研究方法是合理和可行的，是可以再现和复制的，是可以推广应用的。
3、研究结果对学术的贡献和对应用的价值
这一指标强调论文作者对工程硕士专业学位论文的贡献程度，研究结果与现有的结果有什么不同，或者有什么新特点、新发现、新贡献;研究内容有一定的深度和广度，有一定的研究工作量。另外，工程硕士专业学位论文的研究结果对学术的贡献是不言而喻的，除此之外，工程硕士专业学位论文还要考量是否有应用价值和产生经济效益，这是工程硕士专业学位论文与工学硕士论文最大的区别。
4、论文写作规范性
上述3条强调论文的内容，本条则强调论文的范式和写作水平。一篇好的论文应该概念明确、条理清晰、语言通顺、结构合理、逻辑一致、格式规范、用词准确。
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