中国石油大学（华东）生物工程专业学制为3年，最长不错过5年，课程要求总学分最低修满28学分，必修课不得低于15学分。中国石油大学（华东）在职研究生在学习年限生可以延长一年，生物工程是生物学和工程学的有机结合，本领域的主要研究方向包括：能源生物技术、石油生物技术、环境生物技术、生化分离与生物分析、生物反应器设计与过程优化、生物材料及生物基产品的开发与应用等。

生物工程领域覆盖的范围及研究内容如下：

能源生物技术：开展微生物能量物质合成代谢功能优化改造、发酵工艺优化等技术研究，以碳水化合物为原料，开发生物能源新技术与新产品，促进能源多元化体系的形成，以生物质能源缓解石油资源供应压力。

石油生物技术：主要研究微生物勘探与采油、生物防蜡清蜡、微生物脱硫、脱氮及稠油降解的应用基础和工程化。

环境生物技术：主要构建降解危险性化合物和污染物的工程菌及废物强化处理技术。

生化分离与生物分析：主要研究生化产物在分离纯化环境中的稳定性，杂质与产物之间物化及生物性质的区别及分离策略，分离纯化过程的设计等。

生物反应器设计与过程优化：主要研究生物产品的分子设计原理，生物反应及生物加工过程（包括微生物发酵、动植物细胞和组织培养工程、生物催化与生物转化等）的特征与本质，过程优化和放大对生物反应器系统设计、操作和控制的要求。

生物材料及生物基产品的开发与应用：针对生物质能和太阳能转化系统，开发创制优质生物基化学品、高分子材料、有机光电材料和储能材料，解决相关产品、转化体系和系统中的关键技术问题。