武汉大学开设博士专业的学院，主要有资源与环境科学学院、水利水电学院、电气与自动化学院、动力与机械学院、土木建筑工程学院、计算机学院、电子信息学院、遥感信息工程学院、测绘学院、国家网络安全学院、卫星导航定位技术研究中心等。
2023年武汉大学计划招收博士研究生约2100人左右(含直博生、硕博连读生)。招生专业主要有土木水利、电子信息、资源与环境、能源动力、生物医药等。
武汉大学在职博士所有招生单位均通过"申请-考核"方式选拔博士研究生（含各类专项计划）。主要程序包括：网上报名、资格审查、外语综合水平考试、提交材料、确定候选人、综合考核与录取。学习形式分为全日制和非全日制。全日制博士研究生全脱产、在校学习；非全日制博士研究生非脱产学习。
