教材、课程内容设置是课程体系的主要内涵，那么课程体系的构建是否合理，直接关系到新疆财经大学EMBA项目教育培养的质量。结合学分制的实施，新疆财经大学EMBA项目通过走访国内同行院校、网上查询国外同行院校、征求关于在职EMBA项目课程体系改革的意见。在此基础上，新疆财经大学EMBA项目对课程体系进行了大胆的改革，具体包括以下几个方面。

首先是新疆财经大学EMBA项目课程的进性和实用性。为了增加选修课的灵活性，根据一些学校的做法，新疆财经大学EMBA项目可以增加选修课的量，开列多种菜单，以套餐的形式供在职EMBA学员选择。陷阱财经大学EMBA要在科学规划EMBA学员的专业硕士的知识结构、能力结构和素质结构的基础上，安排好他们培养计划中的课程设置。

再次是在教材建设工作中，新疆财经大学EMBA项目采取了以下措施:第一，由在职EMBA项目课程组或任课教师根据课程教学大纲规定的教学内容，按照内容贴近实践、多使用新版教材的原则，指定教材和教学参考书。第二，鼓励课程组或任课教师自编教材。目前已有3门课程使用自编教材，占总课程数的18%。第三，要求新疆财经大学EMBA项目课堂讲授采用多媒体课件教学。

其次是新疆财经大学EMBA阶段的课程安排了与学员管理息息相关的包括力力资源、财务、生产管理、营销、运营等等部门学科，使学员能够充分了解企业各个部门的工作内容和工作任务，从而在管理上能够更加的科学合理。