首先是由于云南大学EMBA项目管理理念落后，云南大学对在职EMBA项目管理的复杂性认识不足。项目管理是一项系统工程，涉及专业众多，需要各专业、各部门的良好协作与配合。最初，云南大学EMBA发展规模不是很大，随着办学经验的丰富和品牌的提升，云南大学EMBA规模越来越大，从最初的由一个班级运行和管理，到后来同时多个班级运行和管理。

其次是由于云南大学EMBA项目复杂性，涉及项目活动不断增多，以前单一的管理手段己经不能适应项目的发展，相反，单一管理手段势必造成各相关岗位人员对应予配合的工作相互推谱，责任无法落实，协调难度大，管理效率低下。

再次是云南大学EMBA项目流程设计不规范。仍然停留在经验管理的阶段，没有规范的流程设计；还缺乏流程考核指标和制度。对精细化的项目管理流程方法缺乏必要的结果考核和行为考核，包括时间、执行人、责任人等考核指标和制度，没有约束限制。

另外还由云南大学EMBA教学团队执行教学任务，每月完成每个班级一门课程和教学活动，最多一个月有三到四个班级上课，最终完成教学目标。企业的使命是为顾客创造价值，而为顾客创造价值的便是流程。成功的企业必然有成功的流程，成功的流程又需要流程管理。在教学管理中，学生便是顾客，如何为学生创造更多的价值，只有不断的改善和优化教学流程，提高教学质量，达到学生对云南大学EMBA项目教学的满意度，同时提升自身品牌树立。