尽管我们有多年培养非全日制工程硕士专业学位研究生培养的经验，在在近年的教学实践和学位培养过程中，我们发现全日制工程硕士研究生培养过程中仍然存在下列主要问题：
1．实践能力培养有待加强
由于非全日制工程硕士专业学位研究生大都来自工矿企业生产或管理第一线，具有一定工作年限和工作经验，表现为很强的实践工作能力。但全日制工程硕士专业学位研究生多数从学校到学校，由于受现有培养条件的限制，专业学位研究生实践能力的训练环节太少，实践能力训练不够。实践能力不仅包括动手能力，更重要的是在实践中分析问题、解决问题的能力及沟通和表达能力。
2．培养目标应进一步明确
专业学位研究生与科学学位研究生的培养目标是不同的，应在学生、学校、社会等各方面各层次进一步明确专业学位研究生特点，使两类研究生在培养目标上的区别更加清晰，防止两类研究生在培养方向的混淆和类同。
3．培养方式应有较大差别
科学学位研究生培养的方式主要是在导师指导下在实验室从事科学研究，注重理论基础和知识创新。专业学位研究生应以培养实践能力为主，侧重解决工程实际问题翻。培养方式上应与科学学位研究生有较大不同，而现在的问题是受惯性和传统的影响，专业学位研究生在培养模式上没有大的突破。
4．培养方案应有特色
由于两类研究生培养的指导思想和目标不同，两类研究生在培养方案上应有较大差别，主要表现在课程设置、考核方式、导师配备、论文选题等方面，而现状是两类研究生在培养方案上区别不大。
5．考核指标与方式应有针对性
科学学位研究生主要考核课程成绩和发表的论文，考核方式主要是考试和答辩。针对专业学位研究生的特点，如何考核专业学位研究生解决实际问题的能力、工程实践能力甚至沟通能力，这是需要我们思考的。
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