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一是采取适应工程硕士特点的培养模式。我国工程硕士教育经过十年来的发展，在GCT入学考试、培养模式、论文要求等方而形成了一套具有特色的工程硕士培养模式，随着社会的不断发展，企业和工程硕士个体的自身需求逐渐呈现多样化趋势。美国工程院在2004年发表的《2020年的工程师》报告中认为，在2020年甚至更远的未来，工程师最需要的素质包括良好的分析能力、灵活的实践能力、创造力、交流能力、商业管理能力、高尚的职业道德与专业精神、终身学习能力。工程硕士教育要从生源类型、课程设置、授课形式、教学安排、论文工作、导师指导等多个环节，研究和探索与多样化需求相适应的科学的培养模式。
二是建立多元化的管理方式。工程硕士规范管理并非要求采用同一种培养模式和同样的管理制度。应给培养单位、学院、教师留出空间，鼓励结合学校实际情况办出特色。各培养单位可根据培养对象行业背景的不同，不断完善各项管理规章制度，制定多元化的培养方案，加强管理人员、教师和学生的质量意识和自我约束能力。在培养单位内部，允许各学院根据不同领域的特点和企业的不同需求，在保证各培养环节的基础上，采取多样化的管理方式。
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