保障工程硕士论文质量的第一步就是合理选题。为实现上述工程硕士培养目标，在职工程硕士的论文选题既要结合学员工作单位的实际需求汉要避免两个极端卜是课题过于简单缺乏工程设计、研制开发、技术改进等必要内容。是理论性过强课题缺乏实际应用背景或实际测试条件论文结果缺乏实际意义或应用价值。在选题阶段导师的正确引导尤为重要。
在避免两个极端的基础上本着“源于实际而高于实际”的原则导师要做的第一件事就是指导学员做好细致深入的调研，使其明确拟研究课题的国内外现状并提出两个以上的课题建议。然后导师需和学员进行充分的讨论与交流，以全面了解学员已有的知识结构、经验积累，以及对几个候选课题的认识程度。据此导师可以帮助学员选择适合的课题包括进行必要的课题融合或者从系统完整性角度对课题内容进行必要的调整和补充。由此可见校内导师若有一定的工程实践经验其在选题的指导上会更为有力。
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此外工程硕士论文切忌追求大而全。针对某一实际问题始出具体、可行的解决方案，深入分析方案中的关键参数或部件的影响并辅以翔实的测试验证使读者在阅读论文之后至少在某一方面有所收获，这样的论文才具有参考价值池必然是一篇合格的论文。
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