中心采用“实验中心+主题实验室+虚拟实验室”的模式建设，一期投入492万。以开展电子类、控制类、计算机类创新项目为主，全校在职博士都可以自由选题中请，经中心令家组审定后，自主进行系统综合设计并完成开发实验工作。中心在此过程中提供一切实验所必需的硬件设备、实验材料，并结合实验实际进程中的问题，提供令家支持而日_全程免费。主题实验室则以航空、航天、航海、机电四个学院为主建设，重点开展微型航行器、机器人、登月车等“三航”特色主题设计。
虚拟实验室是以中心的建设为契机，将学校“211工程”己投资建成的令用实验室，通过在职博士院提供的虚拟平台登记注册，向学生开放的大型、令用、重点实验室。这一创新举措得到了学校领导和各院系领导的关注和支持。虚拟实验室的建立，一是为在实验中心做实验的同学提供了很难得的实验条件，使同学们可以做一些自己平时一想都不敢想的实验，像风洞实验、超高温复合材料实验等;二是全方位地对全校资源进行了整合，充分提高了其利用效率;三是为创新实验中心提供了高层次的技术支持，打出了创新实验中心的特色品牌，提升了创新实验中心的科研档次和整体水平。
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