院系是科研团队建设的负责人，对科研团队的建设要起到具体组织与监督的作用。对于新组建的应用型本科院校，山于科研基础薄弱，有的院系没有形成明确的研究方向，更没有科研团队。在此情况下，院系部门首先要提炼与本部门学科专业密切相关、具有发展前景和前沿性的研究方向，并集中科研骨十教师形成科研团队，为在职研究生培养夯实基础。此外，院系还可以围绕如下几点展开工作，保持科研团队的可持续发展。
1)加强科研平台建设。科研平台为科研团队提供必要的物质基础。院系作为科研团队建设的组织单位，要重视科研平台的建设，要积极申报各类中央地方共建项目、省级实验室建设项目，要抓住机遇，结介院系的学科特色，建设高水平科研水平。
2)选派有潜力的在职教师攻读博士学位。为了增强科研团队的实力，可以选派有潜力的教师到知名高校攻读博士学位，博士课题尽量与科研团队的研究方向相似，博士毕业后可以充实到科研团队中，增强团队实力。
3)鼓励科研团队定期举办全校范围的学术报告。通过学术报告小仅能促进学术交流，培养学术氛围，也能逐渐扩大科研团队在校内外的影响。
4)邀请国内外知名专家来校做学术交流。通过与国外专家而对而的学术交流，可以进一步拓展科研团队的研究视野。
5)鼓励各科研团队的在职研究生定期举办学术论坛，加强在职研究生之间的信息交流。
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