以建筑与土木工程专业硕士在职研究生为例，其培养目标是是培养掌握专业领域坚实的基础理论和宽广的专业知识，具有较强的解决实际问题的能力，能够承担土木工程专业技术或管理工作，具有良好的职业素养的高层次应用型环境人才。但是我校实现建筑与土木工程专业硕士在职研究生培养以来暴露出一些问题如下：
1、生源质量不高，社会认同度低
建筑与土木工程专业学位在职研究生生源多为调剂生，部分学生还是跨专业报考。这些学生的专业基础知识不够扎实，实践动手能力及研究能力相对较差。同时，由于第一年招生的专业学位在职研究生人数较少，单独开课比较困难，目前他们大多与学术型在职研究生一起上课，因而对专业课的学习有一定难度，对本专业的基本概念、方法、技术等系统性学习不够。
2、培养环节没有充分体现专业学位培养的特点
由于专业学位与学术型学位具有不同的培养目标，因而两者应在培养方案的设置、课堂教学、工程实践以及毕业论文等方面有明显的差异。但目前多数学校针对两者的差异并不明显。在课程内容方面太偏重理论，与实践联系太少。同时，专业学位在职研究生的专业课是与学术学位在职研究生一起上的。这是由于在实际执行中，学校专业学位在职研究生的培养目标定位和培养模式尚不够清晰，尚未完全摆脱学术型在职研究生的基本框架，仍以偏学术为主，他们大多与学术型研究生一起上课，工程类课程及专业实践环节不足，专业实践时间偏短或质量不高。未能很好体现专业学位教育特点。这与前期招收的专业学位研究生人数较少，单独开课比较困难有关。目前我校专业型硕士与学术型硕士数量基本持平。因此，建立和完善专业学位在职研究生能力型的培养模式亟待解决。
3、师资队伍工程实践经验不足实践能力有待提高
目前学校的专业学位教师绝大多数兼有指导学术型学位在职研究生和专业学位研究生的双重职责。许多导师往往将指导学术学位研究生的模式直接移植到专业学位在职研究生的指导当中，使学生体会不到专业学位培养的特殊性并从中得到应有的收获。此外，在校外导师方面，尚未建立一支适于专业学位在职研究生教育的专兼职师资队伍，部分学生反映校外导师发挥的作用不是太大。
4、学位论文工程特征不突出，实践方面存在薄弱环节
专业学位在职研究生的论文题目，多数源于导师课题，相当大比例的论文来源与学术学位在职研究生差别不大。专业学位在职研究生的学位论文没有完全脱离学术型学位论文的形式，工程特征不突出。校外实践环节还不太明确，部分学生的实践机会跟指导教师的工作能力和社会交往关系很大，差别很大。在实践时间的长短方面也不统一。
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