科研训练是在职研究生培养的核心。与本科生教育相比，在职研究生教育更加侧重培养学生的创新性研究能力和分析解决实际问题的能力。在在职研究生培养规模与数量迅速扩张的大背景下，在职研究生科研训练的资源变得相对不足。有研究表明，目前我国科研训练已经成为在职研究生培养的薄弱环节(李鑫，2006 )。在我国，跨学科组织的建立几乎都是以目的为导向的，组织运行过程中存在大量的跨学科研究课题和项目。现有各学科边缘地带的科学问题、多学科综合性问题、跨学科问题的研究课题是符合时代要求、最具有研究意义的课题，这种研究有利于提高交叉学科研究的整体科学能力，加速跨学科科研成果的实际应用。在职研究生从事交叉学科领域的涉猎与研究有利于培养其创造性思维方式，有利于突破本学科领域内固有的思维模式，产生具有新思想的思维活动，有利于开阔和发散研究思路。从而摆脱固定思维模式的束缚，从新的视角和新的层面上去观察、分析和研究事物的内在本质与规律。如何整合跨学科组织内科研资源已经成为构建在职研究生科研体系的关键:
(1)开放式实验平台
同国外一流大学相比，我国高校在职研究生科研训练体系相对封闭，不利于激发在职研究生创新性思维。一方面，学校实验设备与仪器的使用门槛较高，在职研究生很难接触一些高端、先进的仪器，同时学校对于设备、仪器的相关知识缺乏有效的整理与传播;另一方面，对于刚刚进夕、跨学科组织的在职研究生来讲，封闭的训练体系难以能使其对将要进行的跨学科研究领域产生充分的认识，这使得学生对研究方向的选择带有很大的偶然性，对人才培养本身非常不利。
为了促进在职研究生科研训练的水平，跨学科组织应整合组织内相关学科的实验资源，降低研究者进入实验平台的门槛，实现实验技术平台最大程度的共享，从而吸引不同学科的研究者一起进行跨学科研究和学术活动，进而促进不同学科间的实质性渗透、交叉和融合，提高跨学科创新型人才培养水平;建立合理的实验室轮转机制，使新入学的在职研究生具有在组织内实验室间进行短期轮转的机会，并在此基础上确定主要的研究方向和实验室;跨学科组织还应该加强开放式实验平台的综合性管理机制建设，加强专业科研人员队伍的整体建设，注意有效收集相关知识并促进其传播。
(2)产学合作实践
企业中的高新技术不只涉及一个学科，它是多学科交叉发展的产物。通过产学研相结合，有利于持续地推进学科的发展，推进知识创新，推进在职研究生}}J新培养(卢建飞等，2006 )。以问题为导向的跨学科组织应积极推动产学研合作创新，以便为跨学科刁}究生提供门i3}的发展空间。产学研实践，不但可以提高在职研究生创造性解决问题的能力，适应社会经济的发展，还可以优化跨学科专业结构，促进跨学科研究的长足发展。
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