统领，是指“统辖率领”，意指在高校弱势学科在职硕士培养体系中，必须以协同创新来“统辖率领”各方的关系与资源。弱势学科在职硕士的培养要求高校积极开发与有效运用协同创新平台，促进在职硕士培养主体的多儿化，合理配置各协同主体的优质资源，从而加快高校弱势学科的建设，培养更多优秀的创新型人才。一般而言，协同创新在高校弱势学科在职硕士培养中的统领关系体现在以下三个方面:
（1）协同创新统领弱势学科的在职硕士人才培养模式。高校协同创新平台具有创新型、交叉型、多主体型等属性，这有利于为高校弱势学科在职硕士提供广泛的选题内容、研究领域和研究方向，为在职硕士配备学术型(高校、科研院所等)、专业型(企业、行业等)的导师队伍，为在职硕士提供校内、校外两个科研实践平台，为在职硕士提供大量学习新理论、新技术、新方法的机会，从而为在职硕士构建立体式的人才培养体系。
(2)协同创新统领弱势学科的在职硕士课程改革。高校协同创新平台以“世界一流，国家急需”为使命，从国家战略高度，对弱势学科的课程设置、教学内容、教学方法等方面进行深度变革，充分吸纳协同创新平台的资深专家、骨干科研人员、创新型技术土人参与弱势学科课程体系开发，以集体智慧编写在职硕士教材，注重理论与实践相结合，打造既富有高校学术品质又颇具企业应用价值的在职硕士教学课程体系。
(3)协同创新统领弱势学科在职硕士科研体系。一是在职硕士可以根据自己的研究兴趣，结合区域经济社会发展需求，在导师的指导下选择自己的研究方向(学术型还是应用型);二是为在职硕士自主选择导师提供更大的空间和更多的自主选择;三是协同创新各主体可以设置各类奖学金或创新创业基金，为提高在职硕士创新能力提供经费支持。
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