由于我国在职研究生目前采取的管理方式是导师负责制，因而对于在职研究生的管理基本取决于导师一人。由于在职研究生的思维己属于成熟阶段，因而导师往往不会过分监督，通常多采取的是任务分配制，规定在有限的时间内完成研究任务。这种柔性的管理模式固然对于在职研究生自我创造性的发挥有着良性的促进作用，但是不可否认的是现在大多在职研究生己经丧失了主动的研究热情与独立的研究能力，他们需要导师的监督和方向的指引。然而实际情况是大多导师工作繁忙，加上学生众多，导师有时无法顾暇对自己学生的管理和教育导致有些在职研究生处于“放羊”和“打工”状态。当然导师对于在职研究生的学术指导不足也是由于在职研究生大规模扩招而导师相对数量的不足等客观原因所造成，但不可否认的是导师对于在职研究生的培养来说是至关重要的，从在职研究生的选拔、课程的传授、研究方向的确定到研究论文的完成都需要导师的指导，导师治学的精神和为人的态度也深深影响着研究生的求学态度。因而，笔者认为导师负责制的局限性是导致在职研究生学术生态危机的原因之一。
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