(1)专业学位要设置专职管理人员。针对工程硕士研究生在校时间少、上课时间分散、管理难度较人的特点，有条件的学校可以设立专业学位办公室，专门负责工程硕士的教学安排和日常的事务管理，包括招生宣传、市场调研、校企联络、教学跟踪及学位授予等工怅在工程硕士规模较人的培养院校，最好在相关的管理办公室内设置由专人负责工程硕士的管理机构。
( 2)企业参与对学生的管理与考核。为了保证工程硕士的培养质量，要加强对学生课程学习和知识掌握情况的监督、管理与考樵企业要直接参与对学生的管理与考核，及时向学校提出建设性意见，并协调校方共同解决好企业与学校、企业与学生、学校与学生、学生与学生以及各级管理部门在培养环节中所遇到的各种问题“校企双导师制”无疑也是一种很好的方式，企业委派高级工程师作为兼职导师，既参与学生培养计划的制词、学位论文的指导，又参与对学生的管理，这样可以提高工程硕士管理的效果。
( 3)建立教师工作质量评价体系和激励机制。工程硕士“工学矛盾”突出，“导师负责制”也存在着弊病，经常出现双方因“忙”而遗漏教学环节的问题在这种情况下，教师如果对教学工作或指导任务有所松懈或对学生采取放任自流的态度，将严重影响培养质鼠因此，要建立教师工作质量评价体系和激励机制，加强对教师教学和指导过程情况的跟踪，对不负责任的教师采取提醒、批评和处罚的方式进行教育，而对工作认真的教师则予以表彰奖励。
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