1、从论文选题的实用性上看
工程硕士的论文选题要求直接来源于生产实际，具有明确的工程背景和应用价值，内容可以是一个完整的工程技术项目或其中的一部分，或工程技术类或应用基础研究类。面学术型的工学硕士在论文的选题上要求具有一定理论背景和理论意义。在论文选题方面两者差异卞要来源于不同的培养目标和培养方式。工程硕士侧重于实际应用，侧重于培养工程实用大才，所以论文评价体系在选题上的评价指标和标准要求论文选题的工程背景与实用价值。面工学硕士强调培养的目标是学术性大才，所以在选题的实用性要求上就不如工程硕士要求，面更强调学术修养和学术理论水平。
2、在文献综述方面
工程硕士论文评价指标体系要求工程硕士对相关领域内的国内外文献资料在一定了解的基础上做出分析与概述。这相比工学硕士对文献综述的要求偏低，这一指标要求的确立，也是与工程硕士培养的实用性复合型大才相适用的。
3、在论文技术难度与工作量上
工程硕士论文评价指标体系对论文的技术难度与工作量上要求有一定的技术难度和工作量，并且工作量不少于1年，这与工学硕士的论文在技术难度与工作量上的要求差别不大。从工程硕士评价的实践看，有些工程硕士论文的技术难度和工程量上还超过了在校的工学硕士论文，这些工程硕士的学员大多是单位中的骨干，在论文上既有理论水平，又有应用价值，这无论在技术难度与工作量上都不低于工学硕士论文的水平。
4、在论文的理论和知识水平上
由于_者培养目标的侧重点不同，工程硕士侧重于工程应用，工学硕士侧重于理论研究，_者是并列面不是包含的关系，在论文的理论和知识水平上，工程硕士的论文评价指标体系与工学硕士的论文评价体系的要求截然不同，工程硕士强调的是应用知识和科技的实用转化，重点强调实用研究，强调如何把基础理论知识运用到实践，把产学研结合起来，面不过分强调理论的前沿性和理论的深度广度。面工学硕士论文评价指标要求论文在理论上是有一定的深度和广度。工程硕士论文研究的对象大多数是工程实际中遇到的工程实际问题，往往具有前瞻性和风险性，追求的是工程实用性的探索与创新。
5、在论文的价值要求上
工程硕士论文评价指标体系要求论文具有直接或潜在的经济效益或社会效益和研究成果的实用性。从这一点来看，工程硕士论文更强调实际的经济价值或社会价值等实用性要求，面不强调论文的理论方面和学术方面的价值意义，这也是在论文的价值要求上，工程硕士论文与工学硕士论文区别的一个重要方面。
6、在论文的创造性上
虽然_者在创造性上都有一定的要求，但是_者的侧重点有所不同。工程硕士论文评价指标大多强调是在应用与科技转化上的创造，用新方法、新技术、新材料解决工程实际问题，面不要求在理论上进行创新。面工学硕士由于是在培养学术型、研究型大才，为进一步充实教学科研活动领域和博士生生源储备大才，所以在论文的创造性上比较重视论文在理论上的创新，重视学生在理论方面的发现与创造。
7、在权重方面
权重的大小，是评价指标在整个评价指标体系中的重要性大小的体现，权值的大小代表该指标在整个评价结果中占的份量的大小。通过对工程硕士论文评价指标与工学硕士论文评价指标体系中各权值大小的比较，也可看出_者在培养目标上的不同，在工程硕士论文评价指标体系中一般在论文的选题、技术难度与工作，成果的应用价值等方面的权重比较大，面在工学硕士的论文评价指标体系中论文的创造性与选题的理论意义所占的权重较大。两个评价指标体系在各权值上的差异也是其培养目标在论文指标评价方面差别的落实与体现。
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