日本的专业硕士在职研究生教育于1974年启动，在日本教育部制定的《大学院设置标准》中，硕士课程目标中加入了“培养高度专门职业所需的高度能力”一条，表达了日本政府希望在在职研究生教育中加强专门职业人才培养的初步设想。1989年日本修订《大学院设置标准》，这一标准体现终身学习的政策导向，积极推进在职研究生教育弹性化，开办夜问大学院，为社会在职人员提供学习方便，扩大研究生教育规模。1999年，日本设置专门培养高层次职业人才的“专门大学院”。2002年，日本中央教育审议会颁发《关于“法科大学院”的设置基准》，之后颁布俨专门职大学院”设置基准》，“法科大学院”和“专门职大学院”的建立，从根本上推动日本专业学位在职研究生教育的发展。
同时，日本还通过修订《学校教育法》，确定“专门职大学院”在研究生教育中的法律地位。《学校教育法》明确规定，“研究生院中，研究学术理论及基础应用，培养从高度专门职业所需之深厚学识及卓越能力者为专业研究生院(专门职大学），这使日本专业硕士教育真正从学术性研究生教育中分离出来。在教育模式上，日本对专业硕士教育提出诸多与学术型在职研究生教育不同的要求。“专门职大学院”更加重视与企业的合作，通过与企业开展协作研究、接受企业委托研究、对企业职员进行在职研究生教育等渠道推进产学研结合，不仅提高了研究生院的研究水平，也提高了人才培养质量。另外，日本专业硕士教育对专任教师的要求也有别于学术型在职研究生教育，明确要求专业硕士在职研究生教育师资中要有一定比例的具备特色职业经验的工作者。在“教职大学院”(相当我国教育硕士研究生培养机构)中，甚至要求有实践经验的教师须占专任教师的40%以上。虽然专业硕士与学术硕士在学分上都要求最低为30学分，但专业学位在职研究生教育并不要求学位论文。
由于政府高度重视，日本在职研究生教育机构得到J陕速发展。1994年全国552所大学中有371所大学设有研究生院，占67%;到2004年，全国726所大学中设有研究生院的有527所，占总数的75%01991年日本在读在职研究生为10万人，是本科生数量的4.8%;到2005年，在读研究生总数已达254480人，达本科生数量的10.1%。其中硕士研究生164550人，博士研究生74907人，专业硕士在职研究生在读数量达到15023人2007年，专业硕士教育迅速发展，专门职业学位课程在学者数为22083人。其中社会学科2007年专门职业学位招生8386人，普通硕士招生8141人，基本持平囚。2007年，日本出台《研究生教育振兴纲要》，进一步促进专业在职研究生教育的发展。
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