一般来说，在职EMBA项目管理以其目标明确、组织灵活等优势而受到越来越多现代企业青睐。而项目管理的基本核心又是项目组织结构作为完成一个项目主要工作的相关利益主体，项目组织结构所起的作用是非常重要的。那么就贵州大学EMBA项目组织结构而言，大致有三种模式：

第一种就是按照职能划分一职能式组织结构一职能部门对应一种专业分工，在组织当前的职能型等级结构下加以管理。每一日项目开始运行，贵州大学EMBA项目的各个组成部分就由各职能单位承担。各单位可负责完成其分管的项目内容。

第二种就是按照项目划分的项目式组织结构。就是指贵州大学创建独立项目团队，这些团队的经营独立于上层组织的其它单位，并有自己的专属的管理和技术人员。企业配给项目团队一定的资源，项目经理是由上层组织直接指派被授权有执行项目的最大自由。

第三种就是混合形式的矩阵式组织结构，是职能式和项目式的一种有效综合在常规的垂直的职能层级结构之上“加载”了一种水平的项目治理结构。针对一个或几个项目职能部门经理对项目组织人员有组织调配和业务指导，资源提供的责任，而项目经理将参与项目组织的职能部门专业技术人员有效组织成项目临时团队统一指挥对项目的结果负责。团队随着项目的开始而开始，随着项目的终结而结束。