学位论文仍是现阶段实现在职EMBA专业学位教育手段之一。在南京理工大学EMBA必要性的看法不一中，大部分“EMBA论文指导老师”对这项培养方式持肯定态度。在EMBA专业学位教育起源的西方，发展到现在仍有许多国家和院校是保留和倡导学位论文制度的。

针对南京理工大学“已经做过EMBA学位论文的毕业生或校友”的完成论文态度所做的调查显示，95%以上的EMBA学生都能以非常认真或是比较认真的态度完成MBA学位论文，从其在EMBA学位论文上花费的时间也能得出这样的结论。为了提高学生撰写MBA学位论文的质量，南京理工大学EMBA会给相关学生提供MBA学位论文写作讲座或者课程。

此外从南京理工大学EMBA学位论文分析中了解，老师对学位论文的作用的各个方面的评价分数明显高于学生，而已经通过学位论文答辩的EMBA学生或校友对学位论文的作用的各个方面的评价分数总体上明显高于其他在读学生。