南京理工大学EMBA专业学位论文虽在形式上与学术型研究生有些许差别，但在撰写时间以及论文类型上限制较严。在调查中发现咨询项目、足够处理实际问题的小项目及足够数量的案例等时间更开放自由的形式受到被试者的支持。
近年来，南京理工大学试点以报告形式代替学位论文，学生两年完成四个报告，其中三个课程报告和一个综合报告；中国农业大学也试点以报告形式代替EMBA学位论文。多样化有利于专业学位研究生发挥特长和优势，为提前进人职场提供情景，以增强研究生的职业意识和职业思维。
但是学位论文仍是现阶段实现在职EMBA专业学位教育手段之一。在研究中对于EMBA必要性的看法不一，但大部分“EMBA论文指导老师”对这项培养方式持肯定态度。在EMBA专业学位教育起源的西方，发展到现在仍有许多国家和院校是保留和倡导学位论文制度的。
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