论文己经担负了太多职能，不仅是在职硕士拿到学位以及报奖，而且也是单位展示科研实力、应付各级部门考核以及教师项目中报与结题、荣誉获奖和职称晋升等最有力的指标。目前，在职硕士仍是我国发表论文的主力军。可以说，发表达到规定数量和级别的学术论文就是在职硕士学习期间的终极目标。但是，客观现实是发表论文越来越难。如何闯过论文难关，保证顺利毕业或者一拿到奖学金，一些学生有意或者一无意地踏进了学术规范禁区。
其一，过十凭借论文来反应在职硕士的综合水平。个人认为取消硕士在职硕士发表论文的规定是更加合理的。硕士在职硕士的培养应该是过程导向而非结果导向，但是本末倒置的现象己经较为常见。在硕士在职硕士阶段，如学术型在职硕士的主要任务是学习如何进行理论研究，而不是看完成了怎样的研究成果，发表了什么级别的学术论文。事实上，硕士在职硕士每年发表的高级别论文占比是很小的。如果一定要求在职硕士发表论文并且和荣誉奖励、导师绩效考核等挂钩的话，势必引发导师和学生的串谋行为和投机主义行为，如论文不挂导师名字，不经导师同意私自投稿等等。从每年评审的学位论文可发现，科研成果中列出的学术论文和学位论文的内容完全没有相关性，让人质疑学生在在职硕士阶段究竟在研究什么，何谈水平?
其二，发表论文的规定存在缺陷。绝大多数在职硕士培养单位都对在职硕士发表论文做出了相关规定，只是论文级别的要求各有不同。总的来看，对论文最低级别要求较高的学校，其在职硕士的学术论文较少出现学术规范问题。一是导师对学生的要求相对严格一些，二是级别较高的期刊对论文的学术规范审查非常严格。但是，一般高校的规定则要宽松得多，为了保证学生都能毕业，附加了一些变通的条款。以积分制为例，规定至少达到2分可毕业，则学生可以选择发表1篇核心期刊论文或是选择发表2篇一般期刊论文。实际情况是，大多数学生选择更轻松的第二种。由十一般期刊论文对学术交流、单位考核、奖励等几乎没有用处，因此导师、期刊不会特别重视学术规范，只要不是完全抄袭。另外，在在职硕士奖学金获得者一选拔时一，很多学校是通过积分制来进行。在达到学习成绩规定条件下，科研积分高者一入选。这就使得一些学生滋生投机行为，通过拼凑、抄袭等手段在短时一间内发表多篇一般期刊论文来拿到很高的科研积分，而让发表了数量少但水平高的论文的学生落选。这种不合理、不公平的竟选规则也在很大程度上助长了学术不端行为。
其三，学术规范教育力度不够和监督不力。二本高校及以下的在职硕士学术论文存在一些学术规范问题是与学校的发展定位紧密相关的。在由教学型向教学科研型大学转型过程中，很多学校都会遭遇研究(导师)队伍困境。很多中老年教师根本没有接受过学术研究的系统训练，或者一接受过但多年己经不做科学研究(学校也极少举办相关培训和讲座)，自己都搞不清学术论文的适当借鉴、征引与抄袭票窃的区别，何谈对在职硕士进行学术规范教育。就在职硕士主管部门而言，为了支撑学校快速发展战略，在论文发表上重数量轻质量，不注重学校的学术声誉，也就容忍一些不规范现象的存在。
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