教学内容的创新是课程创新中的重要方面。创新教学内容，首先要从改变在职研究生教学中教材固定不变的模式着手。长期以来，不少高校的在职研究生课程教学基本上沿用本科教学模式，教材不能够及时更新，学科前沿知识不能够在在职研究生教学中得到及时的讲授和介绍，以致课程内容陈旧，在职研究生不能够站在科技发展前沿研究问题，不能够掌握本学科专业的最新动态，严重制约了在职研究生创新能力的发挥。
根据不同学科专业的特点，课程教学内容的创新应该有所侧重。在长期的办学过程中，传统学科专业积累了丰富的知识，形成了完整的学科专业知识体系，随着产业结构调整和社会经济的发展变化，原有的知识体系从总体上看已经过时，因此，传统学科专业的课程教学内容创新，应将侧重点放在高新技术与传统学科知识的融合上，注重高新技术知识与传统学科知识体系的嫁接，借助高新技术的平台，使传统学科专业的知识体系得到创新和再生。例如，中南林业科技大学在森林工程学科的在职研究生课程教学中，通过详细分析现代森林工程学科发展的趋势，积极探索创新森林工程学科在职研究生课程教学内容的新途径，将传统的《森林采伐学》课程改为《森林资源开发项目管理》，将现代项目管理的知识体系融入到森林资源开发中去，用现代项目管理的理念，对森林资源开发项目的集成管理、范围管理、成本管理、时间管理、质量管理、人力资源管理、沟通管理、采购与合同管理以及风险管理等各个方面进行全面探讨，有效地创新了教学内容。
对于新兴学科和交叉学科，由于学科发展还没有完全定型，没有传统学科的那种知识包袱，教学内容的创新侧重点应是教学内容的组织和界定，比如:哪些内容应作为课程教学的重点，哪些内容只是作为一般的参考，哪些内容看似与该学科领域相关而事实上却不是该学科所能涵盖的，通过这些分析，可以使相关课程的知识体系既达到学科领域的前沿，又具有比较完整的体系。
无论是传统学科还是新兴学科、交叉学科，在课程内容的组织上，一定要紧跟学科专业领域发展的动态和前沿，而不应该只是拘泥于现成教材的讲授。在课程内容的选择和组织上，要尽量避免过于追求知识体系的系统性和完整性的倾向。在职研究生教学与本科生教学是有区别的，本科生教学需要的是系统的完整的专业基础知识，而在职研究生教学更需要前沿的知识和创新的教学内容。因此，对教学内容的选择应有利于在职研究生科学思维和创新思维的培养。在职研究生课程教学内容的安排，要从传授型课程向创造型课程转变，以利于在职研究生掌握相关学科的理论框架体系。在欧美国家的在职研究生教学中，教师总是以理清学科的基本知识框架、思路作为教学的重点内容，编辑所要研究学科的最新最主要的文献资料及与课程相关的论文资料的索引给学生，而不是拘泥于一本教材进行灌输式教学，这种内容体系是值得我们很好地借鉴的。
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