长期以来，在职工程硕士研究生的生源主要是企业的工程技术和工程管理人员，受招生对象的限制，在职工程硕士研究生培养过程具有显著的特点：采用进校不离岗、在职培养模式，受教育者年龄差距较大及基础参差不齐等。
随着在职工程硕士研究生教育的迅速发展，教育规模不断扩大，地方院校已成为培养在职工程硕士研究生的重要力量，但在培养过程中还存在一些问题。
1、培养方案中工程特性不突出
我国工程硕士研究生的培养制度是由工学硕士研究生培养制度演变而来的，地方院校培养在职工程硕士研究生的时间短、经验少，在培养方案制定与课程设置方面尚有很大创新和探索空间。课程设置和教学缺乏实践性，教材、教学内容和方法以及管理模式等与工学硕士的培养方式类似，培养方案的工程特性不突出。
2、培养计划针对性不强
地方院校的在职工程硕士研究生生源比较分散，同一企业中的生源较少，这就需要研究生理论课程阶段要到校集中学习，而多数院校为了便于管理，为同一专业方向的学生制定相同的课程学习计划，导致培养计划针对性不强，未能体现出因材施教的原则。
3、企业导师的作用不能有效地发挥
在职工程硕士研究生采取双导师制的培养方式，在培养过程中，有相当比例的企业导师没有对其课题进行实质性的指导，不能有效发挥其作用。主要原因是企业导师的责任和义务不明确，缺乏有效的约束机制，校内导师和企业导师之间缺乏沟通等。
4、校内导师的工程实践能力不强
目前校内导师具有学历高、理论强而工厂实践能力弱等特点，在指导工程性强的课题时力不从心。
5、论文质量有待提高
工程硕士论文在内容的创新性和规范性方面有待加强。论文形式单一、脱离生产实际，缺少实质的创新性或应用性内容。
针对工程硕士在职研究生培养过程中存在的上述问题，进行具有针对性的在职工程硕士培养新模式的探索就显得尤为重要和迫切。
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