随着我国的EMBA教育规模不断扩大，国内开办在职EMBA的培养院校在学位论文指导过程中出现着一些问题，因此，在这基础上，江西财经大学提出了EMBA学位论文的指导新模式，并根据对EMBA学位论文创新性的界定，提出EMBA学位论文指导过程和答辩模式的创新，以及在创新中要解决的具体问题，为提高江西财经大学EMBA学位论文质量提供了一种思路。

首先了解到是普研最主要是做理论方面的研究，即通过对很多相类似的管理现象进行抽象和分析，找出共性、规律性和一般性，发现值得研究的学术问题，通过提出假说，先建立概念模型或数学模型，再建立仿真模型或使用统计数据和经济计量模型检验或用案例证明提出的假说成立。

其次是论文有着较强的理论倾向其实质是要求理论和方法上的创新，得到理论上的价值。EMBA则不同，他们最主要的是做应用方面的研究，即通过对单个企业或行业的管理现象，发现其存在的问题，并进行深入分析，提出一个可行的解决方案，解决企业管理的实际问题。这类论文有着较强的应用倾向，其实质是要求应用上的创新性，得到应用上的价值。

再次由于EMBA教育是MBA专业学位教育的一种特殊形式，EMBA学位论文过程出现了一些新的问题，如:指导模式的问题、创新型论文的问题、答辩的问题，这些问题的及时解决有助于江西财经大学EMBA学位论文质量控制，保证江西财经大学EMBA学位论文质量。