对于创新型学位论文来讲，指导过程要创新，答辩模式也要创新，应该与一般的在职EMBA学位论文答辩模式有所不同，有专门的答辩程序，该程序在答辩申请、评分标准、评阅人与答辩委员、答辩方式以及申诉上都有不同点。

首先建立一个明确的创新型学位论文评价标准是必要的。在电子科技大学EMBA毕业论文已有一些比较成熟的标准，但在创新性方面的分数一般仅占20—30分，对于创新型学位论文的创新型学位论文评价标准中应增大这种分数，增加其权重。

其次同时要制定合理的创新型论文答辩成绩标准。要有比较明确的解释和说明，什么是优秀，什么是良，什么是及格，什么是不及格。特别是不及格的标准，要制定得比较详细。电子科技大学EMBA答辩委员在参加答辩之前要熟悉这些标准，尽量向标准靠拢，做出理性的判断。EMBA学生在答辩之前也应该知道这些答辩的标准，做到心里有数。