以往在职硕士培养质量评价体系往往是静态的，评价的重点主要停留在论文后期的评市和答辩上。这种评价虽然重要，但存在着明显问题，因为论文成果“木已成舟”，发现的质量问题已很难在培养过程的最后阶段得到改正，这也是个带有普遍性的问题。评价体系实质上也是一种质量保证措施，但这种评价机制也存在着“滞进”作用，只强调把关，忽视了“防患于未然”，不能起到很好的质量保证作用。因此，有必要建立阶段性的动态的创新评价体系。
目前，高校对在职硕士的评价导向使得部分学生的学习目的偏向为分数而学。由于选修课的考试分数在学生成绩中所占的权重不如必修课的权重大，在职硕士实际上并不认真学习选修课目。同时，由于高校对在职硕士的科研实践重视不够，加之，即使有学生参与科研活动，其所作的努力亦不能得到像分数同样重要的评价。主动参与科研活动的学生少之又少，虽然高校一直重视德智体全面发展，但实际上的考试为中心、分数至上的评价导向，使得学生并不主动加强自身的人文修养，提高自己的道德水平，缺乏真正的参与社会实践的动力。
因此，优化对学生的评价机制显得非常重要。优化评价机制，就是要确立重心向创新能力倾斜，建立有利于全面素质提高的评价体系。要以提高学习主体适应于改变社会的能力为观察视野，以学生主体和谐发展为目的，改变单纯以分数为评价标准的状况。这种评价体系应包括思想道德、专业素质、科技素质、文化素质、身心素质、市美素质、能力水平等指标。也就是说，学生在校除学业成绩外，所参加的课外科技活动、社团活动、社会实践、理论学习、文艺活动等内容，特别是科研训练都要作为重要的成绩来评定。
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