与高等院校相比，科研院所系统的整体招生单位多，但招生人数相对偏少，绝大多数单位仅从事在职硕士的培养，研究领域侧重于应用基础和技术研究。根据我国各年度国家教育事业发展统计公报和中国在职硕士招生信息网统计数据表明，2003年，全国从事在职硕士培养的单位720个，其中，313个为科研院所，占全国在职硕士培养单位总数的43.5%; 2007年，全国在职硕士培养单位达973个，科研院所达506个，占全国在职硕士培养单位总数的52.0%，比2003年增加了8.5%。根据教育部发布各年全国教育事业发展统计公报，2003年，全国在职硕士招生人数为26.89万人，2008年达到44.70万人，是2003年的近1.67倍。2003年，科研院所在职硕士招生人数约为3万人，2008年达到6万多人，是2003年的2倍还多。
以中国农业科学院在职硕士招生情况为例，2003年招生人数为475人，2008年增加到736人。从全国硕士和博士在职硕士招生比例来看，总体上保持博士在职硕士招生规模基本稳定，硕士在职硕士招生规模适度增长的趋势。全国在职硕士招生人数，2003年硕士生为22.02万人，博士生为4.87万人;2008年硕士生增加到38.58万人，比2003年增加了75.2%，博士生增加到6.12万人，比2003年增加了25.7%。科研院所这方面未见详细的统计数字，但中国农业科学院的这方面统计结果与全国的增长趋势相似。中国农科院2003年招收硕士生为321名，博士生为154名;2008年硕士生为540人，比2003年增加了68.2%，博士生为196人，比2003年增加了27.2%。科研院所在职硕士培养队伍不断壮大，主要在职硕士培养与科研项目紧密结合，科研优势明高校肩负着教学、科研双重任务，科研课题相对。
有五方面原因:一是在职硕士教育事业发展不仅为其他行业输送了人才，也壮大了科研院所在职硕士导师队伍;二是科技的高速发展迫使更多的已经从事或将要从事科学研究的人员更新自己的知识，以适应本研究领域科技的发展;三是国家增设了硕士点和博士点，研究院所在职硕士培养学科由无到有，由少变多;四是在职硕士培养政策的调整允许在职硕士导师招收更多的在职硕士;五是各科研院所认识到招收在职硕士的益处，重视在职硕士的培养。培养在职硕士不仅能拓展单位的研究学科的深度和广度，同时，在职硕士能够积极参与科研院所承担的科研项目的申清和完成，减轻研究单位在职职工的工作压力，提高科研院所的工作效率。
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