20世纪90年代，伴随我国市场经济体制的建立和国有企业内部改革的深人，大中型企业在市场经济的环境中迫于提高产品研发能力和增加竞争方的需要，对高层次应用型工程技术人才的需求愈加急迫，对工科研究生教育提出了新的要求。
在前10年对工科研究生教育改革与探索的基础上，1996年3月，全国“工科研究生教育改革研究”课题组论证了“设置工程硕士学位的必要性与可能性”，研讨了工程硕士学位的性质、培养目标、类型特征、招生、培养、管理、学位授予以及试点推行等一系列关键问题。同年11月，国务院学位办发出《同意开展在职攻读工程硕士学位试点工作的通知》，提出了设置工程硕士专业学位教育的必要性，标志着工科研究生学位教育迈出了实质性改革的步伐。1997年，国家教育委员会发布“关于实施《工程硕士专业学位设置方案的通知》”，标志着我国工科研究生教育终于突破了单一的学术型学位独霸天下的局面，开始了直接为工矿企业培养高层次应用性工程人才的历程。1998年，经国务院学位委员会批准，全国工程硕士专业教育指导委员会(以下简称“教指委”)成立，这标志着工程专业硕士学位教育进人了新的发展阶段。其发展规模与速度可以从下表中得到清晰的反映。
表1的数据显示 , 2001年以前，专业硕士的招生数量以每年平均12%的速度增长，2001年，工程专业硕士与工学硕士学位的比例逐年增高。到2001年，这一比例达到了55.23%，与美国当今工程硕士与工学硕士的比例相当。
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从1997年工程硕士专业学位正式设立，到2001年我国加人世贸组织，是工程硕士专业学位教育确立并快速发展的时期。期间，工程硕士专业学位的招生人数以平均每年110%的速度递增;占工科研究生招生数量的比例逐年增大，2001年，工程硕士专业研究生的招生数量与工学硕士研究生的招生数量之比达到了55.23%，接近美国20世纪90年代专业硕士学位获得者总硕士学位获得者中所占的比例(美国为56%)。这一时期，获准举办工程硕士学位的培养单位数量迅速增加，开办工程硕士的专业领域不断扩大，招生规模逐年增长，工程硕士教育成为推动工科究生教育快速发展的重要力量。
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